زیارتگاه شیخ اندر آبی قشم در جزیره شیخ اندر آبی قرار دارد و این جزیره از لحاظ موقعیت مکانی در بخش شمالی جزیره قشم و ما بین بندر خمیر ولافت واقع شده است که در حال حاضر این جزیره مسکونی نمی باشد. این جزیره در هنگامی که دریا در حالت مد می باشد قسمت هایی از جزیره به زیر آب فرو می رود و در هنگام جزر بر وسعت آن افزوده می شود. گردشگران با قایق موتوری از بندر لافت در عرض ۵ دقیقه به جزیره شیخ اندر آبی قشم می رسند.
در بخش شمالی جزیره تعداد زیادی از درختان حرا به چشم می خورد و زیارتگاه شیخ اندر آبی قشم در قسمت جنوب شرقی جزیره قرار دارد که با گنبد سفید خود نمایی می کند و برای ماهیگیران و دریانوردان بسیار مورد احترام است.